第１章　物理循環と生物システム
１　大気と水の循環
２　物質循環の「場」と「渦」
３　生物システムに拘束された物質循環
４　「場」における秩序の散逸
５　秩序の結晶としての生物システム
６　生物システムにおける自由度と目的
７　マクロ目的とミクロ目的
８　システム進化とマクロ目的
９　目的論の復権
第２章　生態系の構造と自己組織化
１　生態系の概念と範囲
２　物質、エネルギー、用役による相互依存性
３　森林生態系の物質・エネルギー流の計測例
４　エネルギー流と自己組織化
５　最大呼吸仮説
第３章　線形モデルによる生態系分析
１　線形モデルの可能性と必要性
２　生産者-分解者モデル
３　分解者間の競争と共存
４　最大呼吸構成の安定性
５　モデルの一般化と基本定理
第４章　生態系モデルのシミュレーション
１　モデル生態系の構造
２　最大呼吸問題の定式化
３　最大呼吸解としての群集構成
４　双対解と呼吸廃熱価値体系
５　群集構成の最適性と現実性
第５章　生態系の遷移と動学モデル
１　生体遷移の戦略
２　モデルの枠組み
３　生態系データの導入
４　遷移とターンパイク
第６章　生体系の剰余から経済の剰余へ
１　生態系からの自立と剰余の発見
２　農耕の開始と剰余の自己目的化
３　農業社会の剰余と構造
４　農業社会から工業社会へ
５　労働社会という選択肢
６　剰余と環境危機
７　あらゆる形態の剰余を自然に返す
第７章　近世農業社会の剰余と編成原理
１　近世農業社会の基本問題
２　近世農業と物質循環
３　近世経済の二つのモデル
４　近世農業における技術選択の問題
５　米価値体系としての石高制
６　近世農業社会の不安定性と危機
第８章　近代工業社会と欲求
１　欲求の無制限性
２　欲求の多様化と部分化
３　自然の多様性と人工の多様性
４　欲求のダイナミクス
５　欲求の無制限性と自発的制御
第９章　自然社会と環境価値
１　物質循環表
２　環境能力指標と環境価値体系
３　環境価値と市場価格
４　自然私有の限界と共同管理
終　章　物質循環論の人間像
付録　線形計画の双対定理について